Đêm trước cuộc xâm lược Ba Lan (Kế hoạch Trắng) vào tháng 9 năm 1939, một nhóm nhỏ lực lượng đặc nhiệm Đức mặc trang phục dân sự đã vượt qua biên giới Ba Lan để chiếm các điểm chiến lược quan trọng trước bình minh vào ngày xâm lược.[14] Điều này khiến họ trở thành đơn vị đặc nhiệm đầu tiên thực hiện hành động trong Thế chiến thứ hai.[15] [lower-alpha 3] [lower-alpha 4] Tiểu đoàn Ebbinghaus tham gia vào tội ác tàn bạo chống lại người dân Ba Lan và các tù binh chiến tranh bị bắt.[17] Vào ngày 4 tháng 9, các thành viên của Freikorps Ebbinghaus đã hành quyết 17 người tại Pszczyna, trong số đó có các thiếu sinh Hướng đạo của các trường trung học của thị trấn. Họ cũng tra tấn 29 công dân của Orzesze trước khi xử tử họ.[lower-alpha 5] low [lower-alpha 6] Vào ngày 8 tháng 9 năm 1939, tại thành phố Thượng Silesian, Siemanowice, họ đã xử tử 6 người Ba Lan và sau đó vào ngày 1 tháng 10 năm 1939, bắn chết 18 người ở Nowy Bytom.[18] Các vụ thảm sát lớn hơn được thực hiện ở Katowice, nơi hàng trăm người bị xử tử.[17] Trong vòng hai tuần kể từ cuộc xâm lược Ba Lan, Ebbinghaus đã "để lại dấu vết giết người ở hơn mười ba thị trấn và làng mạc Ba Lan"[19].

Vào ngày 15 tháng 12 năm 1939, đại đội được mở rộng và được chỉ định lại là Tiểu đoàn Brandenburg.[20] Sau khi thành lập, những người lính của đơn vị đặc nhiệm mới ban đầu được sử dụng để bảo vệ các mỏ dầu Rumani và sau đó là nguồn cung cấp quặng crôm từ Thổ Nhĩ Kỳ.[21] Các tiểu đoàn gồm bốn đại đội, tổ chức theo các nhóm ngôn ngữ: những người từ Baltic / vùng lãnh thổ của Nga; những người đã sống ở các vùng lãnh thổ nói tiếng Anh, Bồ Đào Nha và Bắc Phi; Người Đức Sudeten đã nói tiếng Séc, tiếng Slovak và tiếng Ruthian. Ngoài ra, Tiểu đoàn còn có các tình nguyện viên sống ở Belarus, Nga và Ukraina.[22] [lower-alpha 7]

Một trung đội của Brandenburg, trong thực tế, tương đương với quân số của đại đội, tham gia Chiến dịch Weserübung, cuộc xâm lược Scandinavia vào tháng 4 năm 1940, dưới tên Nordzug,[23] trong thời gian đó họ có nhiệm vụ bảo đảm các tài sản chiến lược ở Đan Mạch và Na Uy.[24]

Trong cuộc xâm lược mùa xuân năm 1940 vào Bỉ và Hà Lan (Fall Gelb), các đơn vị Brandenburg đã tỏ ra cần thiết trong việc chiếm giữ "những điểm quan trọng trước những đơn vị thiết giáp của Guderian".[25] Vào ngày 8 tháng 5 năm 1940, các thành viên của đại đội thứ 4 do Leutnant Walther dẫn đầu đã vượt qua biên giới Hà Lan trong đồng phục của cảnh sát Hà Lan. Khi Wehrmacht tiến đến cầu sông Meuse của Gennep, họ nhận ra rằng người Hà Lan vốn đã cài nó bằng chất nổ để ngăn chặn việc người Đức sử dụng. Tuy nhiên, nhóm của Walther, giả dạng hộ tống tù nhân Đức, bất ngờ bắt giữ lính canh ở một bên cây cầu và sau một cuộc giao chiến ngắn với ba người Đức bị thương, trung đội đã chiếm giữ được nhà ga. Những lính canh Hà Lan ở bên kia cây cầu bị rối loạn, khiến cho người Đức không gặp khó khăn gì trong việc chiếm giữ cây cầu, mà sau đó các xe tăng của Wehrmacht đã đi qua.[26] Cùng lúc đó, các đơn vị Brandenburg khác đã chiếm giữ một số cây cầu bắc qua kênh Juliana Canalalalso ở Hà Lan, trong khi những người lính của họ tiến vào Luxembourg, chiếm những cây cầu bắc qua sông Our và ở Bỉ thực hiện những hành động tương tự.[27] Tài liệu của đại đội thứ 3 Brandenburger ghi nhận sau khi xâm nhập vào Bỉ, Lahousen rất hài lòng khi báo cáo rằng, "bốn mươi hai trong số sáu mươi mốt mục tiêu đã được bảo đảm và bàn giao cho các đơn vị theo sau."[28] Vì những chiến tích ở Bỉ và Hà Lan, Brandenburg là một trong những đơn vị được tặng thưởng nhiều nhất khi diễu hành với quân đội Đức xâm lược, khiến họ nhận được sự ngưỡng mộ của chỉ huy Abwehr, Wilhelm Canaris.[29] Vào ngày 27 tháng 5 năm 1940, tham mưu trưởng Bộ Tư lệnh tối cao của các lực lượng vũ trang Đức, Wilhelm Keitel, đã viết cho Canaris rằng Brandenburger đã "chiến đấu xuất sắc" được xác nhận thêm khi Hitler trao tặng Huân chương Chữ thập sắt cho 75% trong số 600 thành viên của đơn vị.[30] Đến tháng 10 năm 1940, Brandenburger tạo thành một đơn vị cấp trung đoàn.[31]

Đơn vị một lần nữa được triển khai trong Chiến dịch Marita, cuộc xâm lược của Balkan.[32] Vào ngày 6 tháng 4 năm 1941, trong Chiến dịch Marita, Brandenburger đã chiếm được cây cầu chiến lược quan trọng trên Vardar và họ cũng bảo vệ hẻm núi trên sông Danube, tạo thành một phần của ranh giới giữa Serbia và Romania được gọi là Cổng sắt. Ngay sau đó, họ chiếm được đảo Euboea.[33] Các hoạt động bổ sung được yêu cầu đối với Brandenburger trong giai đoạn mở đầu cho cuộc xâm lược Liên Xô vào tháng 6 năm 1941, là những người đầu tiên đột kích qua biên giới, phá hủy các cơ sở năng lượng, cắt đường liên lạc, truyền bá thông tin và kích hoạt các điệp viên đang ẩn mình.[34] Nhiệm vụ đáng chú ý nhất của họ là ở cầu Dvina thuộc Daugavpils vào ngày 28 tháng 6 năm 1941, trong đó các thành viên của Đại đội 8 của Brandenburg Kommandos đã đi qua cây cầu trong một chiếc xe tải chỉ huy của Liên Xô, áp đảo lính gác và giữ vị trí trong hai giờ chống lại các cuộc phản kích của lực lượng biên phòng Liên Xô.[35] Từ tháng 6 năm 1942 đến tháng 2 năm 1943, Brandenburger thực hiện các hoạt động đặc biệt đánh phá các tuyến đường tiếp tế của quân Đồng minh ở Bắc Phi bằng các nhiệm vụ bí mật ở Ai Cập, Libya và Tunisia.[36]

Đầu tháng 8 năm 1942, một đơn vị Brandenburg gồm 62 người Đức Baltic và Sudeten do Adrian von Fölkersam chỉ huy đã thâm nhập sâu hơn vào lãnh thổ của kẻ thù hơn bất kỳ đơn vị Đức nào khác. Họ đã được lệnh thu giữ và bảo vệ các mỏ dầu Maykop quan trọng. Ngụy trang thành các binh sĩ và sĩ quan NKVD và sử dụng các chiếc xe tải của Liên Xô, đơn vị của Fölkersam đã đi qua chiến tuyến của Liên Xô và tiến sâu vào lãnh thổ của đối phương. Nhóm Brandenburger di chuyển lẫn vào một nhóm lớn binh sĩ Hồng quân chạy trốn từ mặt trận. Fölkersam đã nhìn thấy một cơ hội để sử dụng chúng cho lợi thế của đơn vị. Bằng cách thuyết phục họ trở về sự nghiệp của Liên Xô, nhóm đã di chuyển gần như theo ý muốn thông qua các trạm kiểm soát của Liên Xô.[37]

Vào ngày 26 tháng 12 năm 1942, những người của Đại đội Dù của Trung đoàn Brandenburg đã được vận chuyển bằng tàu lượn trong một chiến dịch để phá hủy các cây cầu và các tuyến đường tiếp tế được người Anh sử dụng ở Bắc Phi. Đó là một thảm họa. Một số tàu lượn đã bị bắn hạ trong khi bay qua phòng tuyến và một số khác bị phá hủy trước khi tiếp cận được mục tiêu. Hầu hết lính nhảy dù đã thiệt mạng trong chiến dịch.[38]

Các đơn vị của sư đoàn đã được gửi đến Balkan để tham gia vào các hoạt động chống du kích.[lower-alpha 8] Vào ngày 25 tháng 5 năm 1944, các thành viên của sư đoàn, biệt phái trong Tiểu đoàn SS-Fallschirmjäger 500, tham gia chiến dịch Rösselsprung, nhằm mục đích tìm cách bắt giữ lãnh đạo du kích Nam Tư Josip Broz Tito.[40] Vào giữa năm 1943, nhiều đơn vị Brandenburger đã được chuyển từ Balkan và tham gia vào các hoạt động để giải giáp binh lính Ý. Một khu vực quan trọng là đảo Kos, trong chuỗi đảo Dodekanisa ngoài khơi Thổ Nhĩ Kỳ. Kos đã được bảo đảm bởi quân đội Anh vào tháng 9 năm 1943 và một đơn vị đồn trú lớn của quân đội đồng minh Ý cũng có mặt. Cùng với lực lượng nhảy dù Luftwaffe, Brandenburger đã tham gia vào việc chiếm lại hòn đảo.[41]

Vào tháng 9 năm 1944, các lãnh đạo quân sự Đức quyết định rằng các đơn vị hoạt động đặc biệt không còn cần thiết nữa. Sư đoàn Brandenburg trở thành Sư đoàn bộ binh Brandenburg và chuyển sang mặt trận phía đông.[42] Khoảng 1.800 người (bao gồm von Fölkersam) được chuyển đến Tiểu đoàn SS Jäger 502, do SS-Standartenführer Otto Skorzeny chỉ huy, hoạt động trong SS-Jagdverband Mitte, nhưng chủ yếu là SS-Jagdverband Ost cho đến khi chiến tranh kết thúc.[43] Chỉ có Trung đoàn Kurfürst giữ lại vai trò ban đầu là một đơn vị đặc nhiệm.[44]

Phần còn lại của Brandenburger được giao cho Quân đoàn thiết giáp Grossdeutschland, vốn được mở rộng từ Sư đoàn Grossdeutschland từ 1940 đến 1941. Cuối năm 1944, sư đoàn được trang bị một Trung đoàn Panzer và được tổ chức lại thành Sư đoàn Panzergrenadier Brandenburg và trở lại mặt trận. Brandenburger đã tham gia Chiến dịch tấn công Memel, cho đến khi họ rút quân, cùng với Großdeutschland, qua phà tới Pillau. Sư đoàn bị tiêu diệt hoàn toàn trong trận chiến dữ dội gần Pillau và chỉ có 800 người trốn thoát đến mũi nhô Vistula.[45] Trong khi một số người sống sót đầu hàng người Anh ở Schleswig-Holstein vào tháng 5, nhiều Brandenburg, có kỹ năng cao trong việc lẩn trốn, đã biến mất. Những người khác gia nhập Binh đoàn Lê dương Pháp và chiến đấu trong Chiến tranh Đông Dương, nơi mà các kỹ năng của họ đã được chứng minh là một tài sản giá trị.[43] [lower-alpha 9]